Hola Guillermo,
Lo que vas a tener que hacer es particionar tu disco; es decir, dividirlo en 2 secciones de 500GB cada uno. Tu Mac lo reconocerá entonces como si fuean dos discos separados. Para particionar, sigue los siguientes pasos:
1. Abre la Utilidad de Discos de tu Mac (Aplicaciones > Utilidades > Utilidad de Discos)
2. Selecciona el disco de 1TB que deseas particionar
3. Selecciona la pestaña «Partición»
4. En la sección «Disposición de Particiones» haz clic en el símbolo «+» para agregar una nueva partición. Por defecto el disco duro se dividirá en dos partes iguales de 500GB cada una.
5. Dale un nombre y selecciona el formato para cada partición. Verifica que el tamaño de cada una sea el correcto.
6. Selecciona «Aplicar» y espera a que se apliquen los cambios. Ahora cada vez que conectes tu disco duro, este se mostrará como si fueran dos discos separados en Mac. Selecciona uno de ellos para Time Machine, y el otro puedes usarlo para guardar otros archivos de tu interés.